Антон Заболотный родился в латвийском Айзпуте. Начал заниматься футболом в СДЮШОР липецкого «Металлурга». В возрасте 13 лет перешёл в школу ЦСКА. В молодёжном первенстве дебютировал 14 марта 2008 в домашней игре с «Шинником», в 2008—2010 годах сыграл 41 матч и забил 11 голов. 25 ноября и 8 декабря 2009 был в заявке на матчи Лиги чемпионов 2009/10 против «Вольфсбурга» и «Бешикташа». Далее играл в «Волгаре», «Урале»«Уфе»«Динамо» Брянск, «Факеле», где регулярно забивал. Самый голевой отрезок карьеры Антона выдался в «Тосно», где на протяжении двух сезонов за 50 игр он забил 20 мячей.
